Поисковые системы индексировали много дублей страниц. Часть устранили редиректами, частично закрыли от индекса в robots.txt.
Sitemap содержал не все целевые страницы и не обновлялся автоматически. Поправили и выполнили генерацию карты сайта.
Web-страницы сайта по умолчанию генерировались с GET-параметрами, реализовали Человеко-понятный URL для целевых страниц.
Выявили интересный баг - в Html-коде сайта вывод ссылки на страницы с ответом 404, которые JS-кодом подменялись на правильные адреса. Наши программисты нашли источник и добились исправления ошибки.